قادر حسین زاده

مهندسی آنتی بادی اکنون یک حوزه قابل توجه در بیوداروها است زیرا نسل بعدی آنتی بادی های عرضه شده به بازار آنتی بادی های مهندسی شده هستند. در مطالعه حاضر، افزایش میل ترکیبی نانوبادی (Nb) برعلیه فاکتور رشد جفتی (PLGF) توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی (MD) انجام شد. با استفاده از نرم افزار های بیوانفوماتیکی و docking جهش هاش مختلف مورد بررسی قرار گرفت و در نهایت، 4 فرم جهش تک گانه در نانوبادی اولیه ((V0 شامل جهش1. Leu112 به His (V1) ، جهش2. Ser31 به (V2) Asp، جهش3. Ala97 به Lys (V3) ، جهش4. Arg45 به Glu (V4) و 1 فرم جهش دوگانه جهش5. Ser31 به Asp و Arg45 به Glu ((V5 به منظور بررسی جزییات بیشتر و بررسی میل ترکیبی از طریق محاسبه انرژی پیوند، توسط شبیه سازی های MD مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. بیشترین افزایش میل ترکیبی برای جهش Ser31 به Asp در ورینت 2 (V2) به دلیل افزایش قابل توجهی در برهمکنش های قطبی و الکترواستاتیکی مشاهده شد. آنالیز ناحیه تماس و پیوند هیدروژنی و همچنین اندازه گیری فاصله در نانوبادی های جهش یافته وPlGF نیز افزایش میل ترکیبی واریانت های جهش یافته را نسبت به شکل بومی تأیید کرد.